實驗室廢水中成分較為復雜，除了常含的少量的洗滌劑等，還會產生較多的有毒有害物和酸性、堿性及重金屬離子的廢水。因此，
實驗室廢水處理必須遵循合理、科學的原則。若實驗室廢水處理方法不當會導致廢水發生二次化學反應，進而形成嚴重的廢水污染事故。在處理實驗室廢水的過程中，需要遵循以下幾原則：
1、因“水”制宜
實驗室廢水的種類根據其所含成分可以分為許多種，每種廢水中的成分都具有其自身的理化性質，應該遵循其*的理化性質，選擇適合它的處理方法，以得到比較理想的、環保的、經濟的效果，這就是所說的因“水”制宜。
2、盡可能地提高回收率
回收率是指回收的離子量與溶液中這種離子的總量的比值。回收率越高，表明廢水中離子回收的效果越好。努力提高回收率既可以減少經濟損失，又可以達到保護環境的目的。
3、避免其他成分的二次污染
在實驗室廢水的回收中，如果不可避免的要使用其他化學藥品，一定要注意用量，防止這種化學藥品中的成分進入廢液，跟隨廢液一同排出，造成新的污染。
在進行環境監測實驗室廢水的處理時，實驗室中的廢水需用特定的容器進行收集和分類，同時注明廢水的特質、收集日期等數據，以此確保實驗室廢水處理的科學性和合理性。人們要根據廢水種類和特征,進行科學治理，強化源頭管控，實施針對性的防治，推動環境監測實驗室的綠色健康發展。
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